» Biologia molecolare

Premio Eppendorf per giovani ricercatori, il bando è aperto!

admin — Wed, 19 Nov 2014 16:30:58 +0000

Fino al 15 gennaio 2015, i giovani ricercatori che lavorano in Europa che non hanno più di 35 anni possono partecipare al Premio Eppendorf per giovani ricercatori europei.

Questo prestigioso premio riconosce i contributi eccezionali alla ricerca biomedica in Europa sulla base di metodi di biologia molecolare, inclusi i concetti di analisi innovativi. Nel 2015 il Premio Eppendorf per giovani ricercatori europei festeggia 20 anni. Per celebrare questo traguardo, Eppendorf ha aumentato il montepremi a 20.000 euro.

Il vincitore viene selezionato da un comitato di esperti indipendenti presieduto da Reinhard Jahn (Istituto Max Planck di chimica biofisica, Göttingen, Germania).

Il vincitore del Premio 2015 riceverà:

Premio in denaro di 20.000 euro
Un invito alla cerimonia di premiazione presso il Centro di Formazione Avanzata EMBL a Heidelberg, in Germania, il 25 giugno 2015
Un invito a visitare Eppendorf AG di Amburgo, Germania
Copertura della lavoro da parte di Nature sia sulla rivista stampata che on-line (compreso un podcast)

Tutti i dettagli sul Eppendorf Award, i criteri di selezione e passati vincitori del premio sono disponibili all’indirizzo www.eppendorf.com/award . Qui i potenziali vincitori troveranno tutte le informazioni utili per una application.Il Premio Eppendorf per giovani ricercatori europei è presentato in collaborazione con la rivista Nature.

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Fotosintesi artificiale, svelato il fotosistema 2 grazie a spettroscopia

Marta Lombardi — Wed, 23 Jul 2014 19:59:06 +0000

Alcune istantanee di pochi femtosecondi del processo di ossidazione dell’acqua durante la fotosintesi hanno permesso ai ricercatori di capire come funziona il processo in maniera più dettagliata, aprendo la strada alla possibilità di creare un processo fotosintetico artificiale.

Utilizzando una tecnologia laser a raggi X i ricercatori SLAC National Accelerator Laboratory sono stati in grado di acquisire le immagini dettagliate del ciclo di quattro passaggi per l’ossidazione dell’acqua nel fotosistema II, l’unico sistema biologico noto in grado di sfruttare la luce solare per la fotosintesi. Il lavoro, pubblicato su Nature Communications, potrebbe contribuire a promuovere lo sviluppo della fotosintesi artificiale per energia pulita da fonti rinnovabili

“Un metodo efficace per la scissione dell’acqua basato su energia solare è essenziale affinchè la fotosintesi artificiale possa avere successo, ma lo sviluppo di un tale metodo si è dimostrato sfuggente, sino ad oggi”, ha detto Vittal Yachandra dal Lawrence Berkeley National Laboratory.

L’ Uso di diffrazione a raggi X (XRD) e spettroscopia ad emissione di raggi X (XES) a temperatura ambiente ha permesso ai ricercatori di studiare il ciclo catalitico in quattro fasi di ossidazione fotosintetico dell’acqua nel fotosistema II.

“Questo rappresenta un importante progresso verso la caratterizzazione in tempo reale della formazione della molecola di ossigeno nel fotosistema II, e ha permesso di ottenere informazioni che dovrebbero risultare utili per la progettazione di dispositivi artificiali basati energia solare per dividere l’acqua.”

La foto-ossidazione dell’ acqua nel fotosistema II è responsabile della maggior parte dell’ossigeno nell’atmosfera terrestre – al suo interno c’è un nucleo composto da un metalloenzima di manganese e calcio (Mn4Ca) che, quando eccitato da fotoni solari, catalizza in quattro fasi gli stati di ossidazione da S0 a S3 per dare ossigeno molecolare.

I Dati XRD hanno rilevato un segnale di diffrazione anomala dal manganese che i ricercatori ritengono fondamentale per spiegare in dettaglio la formazione del legame ossigeno-ossigeno.

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Genotipizzazione senza estrazione e purificazione di DNA ?

Marta Lombardi — Fri, 18 Jul 2014 17:53:18 +0000

Schema di funzionamento del Lightcycler di Roche

I metodi attuali per la PCR (polymerase chain reaction) utilizzano DNA genomico purificato, per lo più isolato da cellule periferiche del sangue o di globuli bianchi (WBC), che può essere migliorata con un metodo basato su fluorescenza in tempo reale grazie ad energia di risonanza, per una genotipizzazione direttamente a partire dalle cellule sanguigne.

Alcuni Ematologi presso l’ospedale universitario Son Espases (Palma de Mallorca, Spagna) hanno studiato sangue periferico di 34 pazienti raccolti in provette contenenti acido etilendiamminotetraacetico (EDTA). Tra i campioni, hanno incluso una miscela di alleli mutanti per i pazienti affetti da trombosi o emocromatosi ereditaria. I globuli rossi (RBC) sono stati lisati e i globuli bianchi (WBC) isolati. Una PCR in tempo reale è stata infine svolta, seguita da una analisi della curva di fusione di diversi geni tra cui metilentetraidrofolatoreduttasi (MTHFR), emocromatosi (HFE), fattore di coagulazione V Leiden (F5), fattore di protrombina due (F2) e coagulazione fattore XII (F12) .

La PCR in tempo reale è stata eseguita sullo strumento LightCycler 2.0 (Roche Diagnostics). Al fine di uniformare i campioni per la reazione di PCR in tempo reale, le cellule sono state contate in uno Scepter 2.0 Automated Cell Counter (Merck Millipore) e adeguati con 5 × 106 cellule / ml.

Gli autori hanno concluso che il loro protocollo evita la fase di purificazione del DNA, risparmiando così tempo e risorse. Inoltre, poiché la manipolazione effettuata sul campione è minima, può diminuire il rischio di contaminazione. Come hanno segnalato i risultati di una varietà di geni, essi sostengono che il loro protocollo sarà adatto per la genotipizzazione di quasi ogni polimorfismo ereditato. Lo studio è stato pubblicato il 25 giugno 2014, nel Journal of Blood Medicine.

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Diagnosi GastroIntestinale rapida da BioFire, point of care per i paesi in via di sviluppo

Marta Lombardi — Mon, 30 Jun 2014 13:31:02 +0000

BioFire, l’azienda che si occupa di biologia molecolare per conto di bioMérieux ha lanciato il nuovo FilmArray GI Panel (GastroIntestinale) che ha recentemente ricevuto l’approvazione FDA. FilmArray (GI) Panel è essenzialmente lo strumento diagnostico più completo sul mercato per la diagnosi di malattie infettive nelle feci. A differenza delle pratiche diagnostiche attuali, che richiedono prove di laboratorio laboriose seguite da un esame fisico delle feci, il GI Panel FilmArray copre fino a 23 obiettivi sensibili, tra cui batteri, virus e protozoi patogeni come rotavirus, Campylobacter e Giardia lamblia di microrganismi produttori di tossine e persino E . coli responsabile di diarrea.

Le fasi di funzionamento del GI Filmarray, tempo totale 2 ore circa

Questo sistema integra trascrizione inversa, PCR e rilevamento da dove viene eseguita una PCR nested multiplex, seguito da ulteriori analisi. I risultati vengono generati per obiettivo individuale, indicati come ‘rilevato’ o ‘non rilevato’. Il sistema è facile da usare – non è richiesto pipettaggio ed è piuttosto veloce veloce – circa 2 minuti per il setup e con un tempo di risposta di circa un’ora.

Con lo sviluppo della GI FilmArray Panel, i laboratori diagnostici potrebbero risparmiare il tempo di coltura, l’acquisto di terreni e substrati selettivi o differenziali, e ottenere una percentuale di errore minore. Il pannello GI aiuta anche nelle decisioni sulla terapia immediata per i pazienti cui è particolarmente critica durante le epidemie o in coloro che sono affetti da diarrea mediata da enterotossina. Uno strumento che promette di portare point-of-care in luoghi ove le malattie gastrointestinali sono un problema per la salute pubblica e dove la possibilità di effettuare colture cellulari accurate è limitata.

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UCOE Expression System di Merck Millipore – L’espressione di proteine umane ad alta efficienza

Marta Lombardi — Thu, 13 Mar 2014 08:52:28 +0000

Nelle cellule eucariotiche, l’efficacia dei vettori di espressione dipende dal sito di inserzione nel genoma. Nel caso di una transfezione stabile, l’inibizione dell’espressione può dipendere da elementi endogeni e dalla struttura della cromatina. I tempi di selezione dei cloni cellulari a più alta espressione ed il raggiungimento di alti livelli di espressione sono due punti chiave nella messa a punto di un efficiente processo di produzione di anticorpi, enzimi e proteine umane. Per superare queste problematiche e migliorare l’efficienza del processo Merck Millipore rende disponibile sul mercato i vettori di espressione UCOE. Questi vettori contengono la sequenza ubiquitous chromatin opening element (UCOE) che consente di superare le problematiche dovute all’integrazione genomica, aumentando i livelli di espressione e il numero di cellule attive.

Le sequenze UCOE sono degli elementi regolatori derivati da promotori associati a geni Housekeeping. Questi elementi hanno una funzione di rimodellamento della cromatina che consente il mantenimento della cromatina in una configurazione permissiva. Le caratteristiche degli elementi UCOE consentono un aumento consistente dei livelli di espressione e un elevato numero di cellule ad alta produzione, questo rende possibile un’ alta produzione di proteine e dei tempi rapidi per un scale-up produttivo del sistema.

I vettori UCOE consentono in ambito di ricerca di una facile selezione di cloni di espressione stabili ed in ambito produttivo un rapido scale-up dei volumi e delle quantità.

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