Sensore Irys Chip V2 per analisi strutturale del DNA presentato ASHG 2013

dettaglio del chip IrysChip V2

BioNano Genomics ha annunciato il lancio di un nuovo chip ad alta produttività per l’analisi del genoma umano. Il nuovo IrysChip V2, che utilizza la piattaforma Irys System, permette una piena rilevazione di variazioni strutturali in ogni genoma umano con una velocità maggiore di 15 volte rispetto ai dispositivi esistenti.

Il nuovo IrysChip V2, lanciato al Meeting Annuale della società americana per la genetica umana del 2013 a Boston (ASHG), apre la strada ai ricercatori per lo studio del significato biologico di queste variazioni strutturali. Una piena comprensione di queste variazioni strutturali e dei loro effetti ha un’enorme importanza nella scoperta di farmaci, in diagnostica, in agricoltura, nello sviluppo di bio-energie e in altre aree.

Il sistema Irys System per anlisi del DNA

Nonostante la connessione tra le variazioni strutturali nei genomi e alcune condizioni mediche siano note,  prima del lancio di IrysChip V2 era pressoché impossibile indagare nel dettaglio le correlazioni a livello molecolare per la gran parte di esse . Il nuovo chip nel sistema Irys, grazie alla tecnologia a lunga lettura, consente ai ricercatori di analizzare la struttura del DNA, fino a un milione di paia di basi e di rilevare le variazioni strutturali quali l’eliminazione, la duplicazione,

il numero di copie, le variazioni, le inserzioni, ecc. in ogni genoma. IrysChip, con il proprio vettore NanoChannel  linearizza il DNA e previene la piegatura o la sovrapposizione delle molecole una sull’altra e crea una lunga mappa precisa di una vasta gamma di genomi utilizzando campioni di DNA  inferiori a 300ng in dimensione per ogni singolo campione. IrysChip V2 ha una portata di 50/10 GB per chip, con 2 flowcell che hanno 13.000 nano-canali paralleli a testa, ed è in grado di rappresentare diverse giga-basi di DNA all’ora.